Menurut laporan FDA, kesan sampingan yang paling biasa semaglutide termasuk loya, cirit-birit, muntah, sembelit, sakit perut, kembung perut, pening, sakit kepala, senak, hipoglikemia, gastroenteritis, dan penyakit refluks gastroesophageal.

Dalam kes yang lebih serius, semaglutide boleh menyebabkan pankreatitis, batu karang, kecederaan buah pinggang akut, kerosakan retina dan peningkatan kadar denyutan jantung.

Orang yang mengambil semaglutide mempunyai insiden pankreatitis 4.6 kali lebih tinggi daripada mereka yang mengambil jenis ubat pelangsing-berat badan yang lain dan ia juga dikaitkan dengan peningkatan insiden gastroparesis.